Di desa roh yang ramai, Yuzu, seorang gadis rubah yang ceria, memulai pekerjaan pertamanya sebagai pelayan di penginapan sumber air panas tradisional Konohanatei. Meskipun Yuzu tidak memiliki pengalaman bekerja di perusahaan kelas atas, Kiri, kepala pelayan yang ramah dan dapat diandalkan, segera mempekerjakannya untuk mempelajari dasar-dasarnya.
Meskipun keinginan Yuzu pada awalnya terbukti lebih merupakan penghalang daripada berkah, sifat cerianya membawa daya tarik unik ke penginapan, karena baik pelanggan maupun rekan kerjanya dengan cepat menyadari kesalahannya yang kikuk namun bermaksud baik. Di bawah bimbingan rubah lainnya—Satsuki yang kaku, Natsume yang periang, Ren yang kritis, dan Sakura yang pendiam—Yuzu terus mempelajari keterampilan pelayan penginapan sambil belajar mencintai dunia magis di sekitarnya.
Konohana Kitan menyajikan kisah mengharukan tentang seorang gadis rubah sederhana yang menjalin ikatan dengan orang lain dan menemukan rumah di tengah dunia roh yang misterius dan indah.