Yukito Kunisaki sedang dalam perjalanan mencari Gadis Bersayap yang terikat ke langit berabad-abad yang lalu, setelah mendengar kisah masa kecil dari ibunya. Saat Yukito menunjukkan pertunjukan bonekanya kepada orang-orang dalam upaya menghasilkan uang, dia mendapati dirinya berada di sebuah kota kecil di mana dia tidak berharap untuk tinggal lama. Namun, ketika ia bertemu dengan seorang gadis yang tidak biasa bernama Misuzu, keadaan berubah drastis saat ia diundang untuk tinggal bersamanya.
Dengan tinggal di kota kuno, Yukito segera berteman dengan penduduk setempat. Saat dia mengenal mereka lebih baik, dia mengetahui masalah mereka dan memutuskan untuk membantu, sehingga pencariannya terhadap Gadis Bersayap ditunda. Dengan pencariannya yang tertunda, dan keterikatannya yang semakin besar pada Misuzu dan kota kecil, akankah Yukito menemukan Winged Maiden, atau apakah dia lebih dekat dari yang dia kira?