Legenda menceritakan bahwa ketika Bumi hancur, pembuat jam besar Y membuat pengganti roda gigi. Naoto Miura adalah seorang anak muda yang bercita-cita menjadi pembuat jam yang hebat. Namun, terlepas dari bakat uniknya—pendengaran sensitif yang dapat langsung memahami mekanisme jarum jam hanya dari kebisingan—dia hanya mengalami sedikit kemajuan. Tapi ini berubah ketika peti mati jatuh dari langit ke dalam apartemennya, memperlihatkan RyuZU, robot wanita yang ditempa oleh Y sendiri.
Berita kedatangan RyuZU membawa Marie Bell Breguet, pewaris berbakat dari jajaran pembuat jam terkemuka, dan pengawal cyborgnya, Vainney Halter, ke dalam kehidupan Naoto juga. Ketika dia dan Naoto sama-sama terlibat dalam pertarungan penuh aksi untuk hidup mereka, mereka menemukan kenyataan yang tidak menyenangkan: planet jarum jam tempat umat manusia hidup selama lebih dari satu milenium mulai runtuh—sebuah rahasia yang akan dibunuh oleh banyak orang untuk dilindungi. .