Kazuya Kujou adalah pelajar asing di Akademi Saint Marguerite, sebuah sekolah berasrama mewah di negara Sauville, Eropa Selatan. Berasal dari Jepang, rambut hitam pekat dan mata coklat tua menyebabkan teman-temannya menjauhinya dan memberinya julukan “Penuai Hitam”, berdasarkan legenda urban populer tentang pengelana yang membawa kematian di musim semi.
Pada hari seperti hari-hari lainnya, Kujou mengunjungi perpustakaan sekolah yang mewah untuk mencari cerita hantu. Namun, fokusnya segera berubah saat dia penasaran dengan sehelai rambut emas di tangga. Langkah-langkah tersebut membawanya ke sebuah taman besar dan seorang gadis cantik seperti boneka yang dikenal sebagai Victorique de Blois, yang pandangan ke depannya yang kompleks dan imajinatif memungkinkannya untuk memprediksi masa depan mereka, yang kini saling terkait.
Dengan semakin banyaknya misteri yang berkembang pesat—termasuk kemunculan kapal hantu dan alkemis dengan kekuatan transmutasi—Victorique dan Kujou, yang terikat oleh takdir dan keterampilan unik mereka, tidak punya pilihan selain mengandalkan satu sama lain.